• Разработка технологий выделения и очистки рекомбинантных и природных белков.
• Изучение структуры, функций и механизмов действия белковых молекул класса цитокинов, гормонов, белков системы комплемента, оксиредуктаз in vitro и in vivo (в организмах человека и животных).
• Разработка субстанций и готовых лекарственных форм на основе рекомбинантных белков для производства лекарственных препаратов.
• Разработка методических подходов к получению гибридом, продуцирующих моноклональные антитела с заданными свойствами.
• Исследования по созданию и применению новых форм лекарственных препаратов, обеспечивающих повышение их терапевтической эффективности.
• Разработка технологии конструирования рекомбинантных гуманизированных антител для терапии аутоиммунных и злокачественных заболеваний.
• Разработка иммуноферментных тест-ситем для количественного анализа белков и пептидов.
• Разработка препаратов, обладающих радиопротекторными свойствами.
• Разработка и совершенствование способов доставки лекарственных веществ.

• Создание нового отечественного лекарственного препарата «Беталейкин» на основе рекомбинантного интерлейкина-1β, предназначенного для комплексной терапии рака и лечения хронических инфекционных болезней.
• Исследование возможности применения новых лекарственных форм рекомбинантного интерлейкина-1β для местного применения и разработка мазевой формы препарата «Беталейкин» для лечения трофических язв и плохо заживающих ран.
• Исследование противовоспалительных свойств рецепторного антагониста интерлейкина-1 (ИЛ-1ра) при различных патологиях в модельных экспериментах на животных совместно с и Национальным фармацевтическим университетом, г. Харькова, Украина и ИНЦ РАН С.-Петербург.
• Создание противовоспалительного лекарственного препарата «Ралейкин» на основе рекомбинантного рецепторного антагониста интерлейкина-1 для лечения аутовоспалительных болезней.
• Присуждение премии Правительства Российской Федерации 2006 года в области науки и техники – за конструирование продуцентов, организацию биотехнологического производства субстанций и препаратовна основе рекомбинантных цитокинов человека и внедрение разработанного медицинского препарата «Беталейкин» совместно с ФГУП ГНИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов, РОНЦ им. Н.Н.Блохина, ГУ НИИ онкологии им.проф. Н.Н.Петрова, ФГУП ГНЦ – Институтом биофизики ФМБА России.
• Создание лекарственных препаратов «Интерфераль» на основе рекомбинантного интерферона α-2b для парентерального и аэрозольного применения.
• Разработка линейки лекарственных препаратов под общим торговым названием Рексод® на основе рекомбинантной супероксиддисмутазы человека.
• Получение инновационных молекул антител к цитокинам интерлейкину-6 (ИЛ-6) и фактору некроза опухолей альфа (ФНОα), компоненту С3 и фактору D системы комплемента, создание генно-инженерных продуцентов этих белков и конструирование терапевтических антител на основе этих молекул с использованием компьютерного моделирования антител и взаимодействий антиген-антитело.
• Исследования по созданию гемосорбентов на основе гуманизированных антител для удаления провоспалительных цитокинов ИЛ-6 и ФНОα из крови септических больных методом экстракапоральной гемоперфузии.
• Исследование противоопухолевых свойств рекомбинантного белка теплового шока 70 человека и разработка лекарственного препарата на его основе совместно с Институтом цитологии РАН С-Петербург.
• Исследование свойств регулятора развития и функционирования репродуктивной системы – рекомбинантного антимюллерова гормона (АМГ) человека и возможности его использования для терапии опухолей репродуктивных органов человека.
• Создание иммуноферментных диагностикумов для оценки цитокинового статуса и состояния системы комплемента человека на основе панели моноклональных антител.
• Разработка рекомбинантных субстанций и исследование радиопротекторных свойств рекомбинантных белков интерлейкина-1β и флагеллина совместно с ФГУП ГНЦ – Институтом биофизики ФМБА России.
• Разработка методических рекомендаций по применению антиоксидантного препарата Рексод® для профилактики развития лучевых реакций и поздних лучевых повреждений у больных во время и после проведения лучевой терапии совместно с МРНЦ РАМН (г. Обнинск).
• Разработка подходов к персональной антиоксидантной терапии на сновании изучения про- и антиоксидантного статуса организма.
• Исследование роли комплемента и цитокинов в центральной нервной системе.

1. Антипова Т.О., Антропова Г.Ф., Ищенко А.С., Кетлинский С.А., Митрофанов Е.В., Пигарева Н.В., Полякова Е.А., Протасов Е.А., Соловьева Л.Я., Симбирцев А.С. Способ получения препарата интерлейкина-1бета. Патент РФ № 2234513, 27.01.2004, приоритет от 31.07.2002.
2. Соловьева Л.Я., Чурилова И.В., Княжев В.А., Калошин В.Г., Антипова Т.О., Федорова Н.М. Способ выделения супероксиддисмутазы. Патент РФ № 2186848 от 10 августа 2002 г. приоритет 16 мая 2001.
3. Антипова Т.О., Антропова Г.А., Ищенко А.М., Кетлинский С.А., Митрофанов Е.В., Пигарева Н.В., Полякова Е.А., Протасов Е.А., Свентицкий Е.Н., Симбирцев А.С., Соловьева Л.Я., Фролов В.Н., Шалаева О.Н. Способ получения рекомбинантного антагониста рецептора интерлейкина-1 человека «Арил». Патент РФ № 2326947, 20.06.2008, приоритет от 23.11.2004.
4. Ищенко А.М., Митрофанов Е.В., Симбирцев А.С., Соловьева Л.Я., Мартюшин С.В., Родин С.В., Жахов А.В., Полякова Е.А., Антипова Т.О., Протасов Е.А., Котов А.Ю., Трофимов А.В., Свентицкий Е.Н. Способ получения рекомбинантного интерферона альфа-2b и интерферонсодержащий препарат (варианты). Патент РФ № 2294372, 27.02.2007, приоритет от 16.06.2005.
5. Ищенко А.М., Митрофанов Е.В., Симбирцев А.С. и др., Штамм Escherichia coli BL21(DE3)[pAYDC-EN-(hIFN-α2b)-lac] — продуцент рекомбинантного человеческого интерферона и способ его культивирования. Патент РФ № 2303063, 20.07.2007, приоритет от 29.09.2005.
6. Симбирцев А.С., Ищенко А.М., Варюшина Е.Н., Александров Г.В. Композиция для лечения повреждений слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта. Патент РФ № 2361606, 10.01.2009, приоритет от 04.07.2007.
7. Ищенко А.М., Симбирцев А.С., Мартюшин С.В., Соловьева Л.Я., Антипова Т.О., Антропова Г.Ф., Котов А.Ю., Митрофанов Е.В., Полякова Е.А., Протасов Е.А., Гончарова С.В., Горбунова И.Н., Пигарева Н.В., Петров А.В. Цитокинсодержащая аэрозольная композиция. Патент РФ № 2410082, 27.01.2011, приоритет 26.11.2009.
8. Пигарева Н.В., Ищенко А.М., Петров А.В., Климов Н.А., Симбирцев А.С. Штамм культивируемых клеток CHO-IL7/13 — продуцент интерлейкина-7 человека. Патент РФ № 2562169, 10.08.2015, приоритет от 29.10.2012.
9. Ищенко А.М., Симбирцев А.С., Маргулис Б.А., Гужова И.В. Штамм бактерий Еscherichia coli – продуцент белка теплового шока 70 и способ получения препарата белка теплового шока человека. Патент РФ № 2564120, 01.09.2015, приоритет от 10.07.2013.
10. Ищенко А.М., Симбирцев А.С., Маргулис Б.А., Гужова И.В., Шевцов М.А. «Способ терапии опухолевых заболеваний» Патент РФ № 2597414, 23.08.2016, приоритет от 28.08.2013.
11. Пигарева Н.В., Трофимов А.В., Родин С.В., Жахов А.В., Ищенко А.М, Петров А.В., Климов Н.А., Симбирцев А.С. Моноклональное антитело против интерлейкина-6 человека, и гибридома, продуцирующая данное моноклональное антитело. Патент РФ № 2550262, 08.04.2015.
12. Трофимов А.В, Родин С.В., Жахов А.В., Горбунов А.М., Вахрушев А.В.. Картузова В.Е., Ищенко А.М. Штамм клеток яичников китайского хомячка – продуцент рекомбинантного антитела против фактора некроза опухоли альфа человека. Патент РФ № 2556816, 18.06.2015, приоритет от 12.03.2014.
13. Шевцов М.А., Ищенко А.М., Жахов А.В., Симбирцев А.С. Способ лечения отека головного мозга. Патент РФ № 2563123, 19.08.2015, приоритет от 24.07.2014,
14. Ищенко А.М., Симбирцев А.С., Антипова Т.О., Полоцкий А.Е., Жахов А.В., Пигарева Н.В., Шевцов М.А. Способ лечения инсульта. Патент РФ № 2571282, 19.11.2015, приоритет от 22.05.2014,
15. Картузова В.Е., Трофимов А.В., Ищенко А.М., Родин С.В., Жахов А.В., Климов Н.А., Петров А.В., Карасев М.М. Моноклональное антитело СС3-4 к конформационному эпитопу С3 человека, штамм гибридной днк мыши РККК(П)764Д — продуцент моноклонального антитела СС3-4. Патент РФ № 2584582, 22.04.2016, приоритет от 16.03.2015.
16. Ищенко А.М., Кудлинг Т.В., Петров А.В.. Пигарева Н.В., Протасов Е.А.. Симбирцев А.С. Синтетическая ДНК, кодирующая интерлейкин-7 человека, содержащий ее экспрессионный вектор (варианты), штамм-продуцент интерлейкина-7 человека и способ получения интерлейкина-7 человека. Патент РФ № 2615447, 04.04.2017, приоритет от 13.11.2015.
17. Петров А.В., Карасев М.М., Кудлинг Т.В., Пигарева Н.В., Сергеева В.Е., Трофимов А.В., Ищенко А.М., Горбунов А.А., Вахрушев А.В., Симбирцев А.С. Синтетическая ДНК, кодирующая антимюллеров гормон человека, содержащий ее экспрессионный вектор pTVK4pu/MISOPT и штамм клеток яичников китайского хомячка СНО-MIS — продуцент рекомбинантного антимюллерового гормона человека. Патент РФ № 2616273, 13.04.2017, приоритет от 21.04.2016 г..

1. Е.Г. Щекина, С.Ю. Штрыголь, А.М. Ищенко. Взаимосвязь психотропных свойств рекомбинантного рецепторного антагониста интерлейкина-1 с изменением уровня моноаминов в головном мозге мышей. Цитокины и воспаление 2011, 10, 4, с.21-26.
2. Ищенко А.М., Щекина Е.Г., Штрыголь С.Ю., Дроговоз С.М., Симбирцев А.С. Изучение церебропротекторных свойств рекомбинантного рецепторного антагониста интерлейкина 1 человека (IL-1Ra) в эксперименте I. Влияние IL-1Ra на кровоснабжение головного мозга, нарушения кислотно-щелочного баланса, деструкцию нейронов и содержание интерлейкина 1 при экспериментальной церебральной ишемии у крыс. Цитокины и воспаление 2013, 12, 1-2, с.45-51.
3. Щекина Е.Г., Ищенко А.М., Штрыголь С.Ю., Дроговоз С.М., Симбирцев А.С. Изучение церебропротекторных свойств рекомбинантного рецепторного антагониста интерлейкина 1 человека (IL-1Ra) в эксперименте II. Церебропртекторные свойства IL-ra при ишемическом и травматическом поражении головного мозга у мышей. Цитокины и воспаление 2013, 12, 3, с.29-34.
4. Е.Г. Щекина, С.Ю. Штрыголь, С.М. Дроговоз, И.А. Зупанец, С.К. Шебеко, А.М. Ищенко, А.С. Симбирцев. Влияние рекомбинантного рецепторного антагониста интерлейкина 1 на метаболизм соединительной ткани в условиях стероидного остеоартрита у крыс. Цитокины и воспаление. 2013. Т. 12. № 4. С. 63–70.
5. 5. Ischenko A, Sayah S, Patte C, Andreev S, Gasque P, Schouft MT, Vaudry H, Fontaine M. Expression of a functional anaphylatoxin C3a receptor by astrocytes. J Neurochem. 1998; 71(6):2487-96.
6. Sayah S, Ischenko AM, Zhakhov A, Bonnard AS, Fontaine M. Expression of cytokines by human astrocytomas following stimulation by C3a and C5a anaphylatoxins: specific increase in interleukin-6 mRNA expression. J Neurochem. 1999; 72(6):2426-36.
7. Mogilenko DA, Kudriavtsev IV, Trulioff AS, Shavva VS, Dizhe EB, Missyul BV, Zhakhov AV, Ischenko AM, Perevozchikov AP, Orlov SV. Modified low density lipoprotein stimulates complement C3 expression and secretion via liver X receptor and Toll-like receptor 4 activation in human macrophages. J Biol Chem. 2012, 17;287(8):5954-68.
8. Nikolaev B.P., Yakovleva LY, MiKhalev Ya.Yu., Marchenko Y.Y., Gepetskaya M.V., Ischenko A.M., Slonimskaya S.I., Simbirtsev A.S. The inflammatory response of respiratory system to metal nanoparticle exposure and it’s suppression by redox active agent and cytokine therapy. I n the book: Recent trend in electrochemical science and technology. Ed. By U.K.Sur. Copyright© 2011 InTech. Chapter 10, p.223-246, http://www.intechopen.com/download/get/type/pdfs/id/26966
9. Shevtsov M.A., Nikolaev B.P., Yakovleva L.Y., Marchenko Y.Y., Dobrodumov A.V., Mikhrina A.L., Martynova M.G., Bystrova O.A., Yakovenko I.V., Ischenko A.M. Superparamagnetic iron oxide nanoparticles conjugated with epidermal growth factor (SPION-EGF) for targeting brain tumors. Int J Nanomedicine. 2014;9, 273-87.
10. Shevtsov M.A., Yakovleva L.Y., Nikolaev B.P., Marchenko Y.Y., Dobrodumov A.V.,
11. Onokhin K.V., Onokhina Y.S., Selkov S.A., Mikhrina A.L., Guzhova I.V., Martynova M.G., Bystrova O.A., Ischenko A.M., Margulis B.A. Tumor targeting using magnetic nanoparticle Hsp70 conjugate in a model of C6 glioma. Neuro Oncol. 2014;16, 1, 38-49.
12. Shevtsov MA, Nikolaev BP, Yakovleva LY, Dobrodumov AV, Zhakhov AV, Mikhrina AL, Pitkin E, Parr MA, Rolich VI, Simbircev AS, Ischenko AM. Recombinant interleukin-1 receptor antagonist conjugated to superparamagnetic iron oxide nanoparticles for theranostic targeting of experimental glioblastoma. Neoplasia. 2015;17(1):32-42.
13. Shevtsov MA, Nikolaev BP, Yakovleva LY, Dobrodumov AV, Dayneko AS, Shmonin AA, Vlasov TD, Melnikova EV, Vilisov AD, Guzhova IV, Ischenko AM, Mikhrina AL, Galibin OV, Yakovenko IV, Margulis BA. Neurotherapeutic activity of the recombinant heat shock protein Hsp70 in a model of focal cerebral ischemia in rats. Drug Des Devel Ther. 2014;8:639-50.
14. Shevtsov MA, Pozdnyakov AV, Mikhrina AL, Yakovleva LY, Nikolaev BP, Dobrodumov AV, Komarova EY, Meshalkina DA, Ischenko AM, Pitkin E, Guzhova IV, Margulis BA. Effective immunotherapy of rat glioblastoma with prolonged intratumoral delivery of exogenous heat shock protein Hsp70. Int J Cancer. 2014 Nov 1;135(9):2118-28.
15. Shevtsov MA, Nikolaev BP, Yakovleva LY, Marchenko YY, Dobrodumov AV, Mikhrina AL, Martynova MG, Bystrova OA, Yakovenko IV, Ischenko AM. Superparamagnetic iron oxide nanoparticles conjugated with epidermal growth factor (SPION-EGF) for targeting brain tumors. Int J Nanomedicine. 2014;9:273-87.
16. Dubinina E.E., Churilova I.V., Lipatova L.V., Zhuravleva L.V. Experience of Using the Recombinant Human Superoxide Dismutase Drug in Neurological and Ophthalmological Practice. Open J. of Med. Chem. 2014; 4:70-78.

• Дизайн активных агентов кандидатных вакцин против вирусных и бактериальных инфекций.
• Получение активных агентов кандидатных вакцин с использованием технологии рекомбинантной ДНК.
• Разработка лекарственных препаратов на основе моноклональных антител.
• Разработка технологий выделения и очистки рекомбинантных белков и плазмидных ДНК.
• Разработка субстанций и готовых лекарственных форм на основе рекомбинантных белков для производства лекарственных препаратов.

• Разработана технология получения рекомбинантного CRM197 в клетках E. coli.
• Разработка конъюгированных вакцин на основе синтетических углеводных лигандов против возбудителей госпитальных инфекций.
• Разработана кандидатная вакцина против ротавирусной инфекции на основе рекомбинантного белка FliCVP6VP8 и проведены ее доклинические исследования.
• Разработана кандидатная вакцина против туберкулеза на основе рекомбинантных белков TB10.4 и Ag85B Mycobacterium tuberculosis и проведены ее доклинические исследования.
• Разработана кандидатная вакцина против патогенных штаммов холеры на основе рекомбинантного белка, проводятся ее доклинические исследования.
• Разработана кандидатная универсальная ДНК-вакцина против вируса герпеса человека, проводятся ее доклинические исследования.
• Проводятся доклинические исследования разработанного лекарственного средства на основе моноклонального антитела, специфичного к белку р17 ВИЧ-1, для терапии ВИЧ-инфекции.

1. Симбирцев А.С., Духовлинов И.В. , Богомолова Е.Г., Добровольская О.А., Федорова Е.А., Ищук С.А. Штамм Escherichia coli BL21 DE3 pColdIII-1269A, способ получения белка crm197 и вакцинная композиция на его основе
2. Духовлинов И.В., Богомолова Е.Г., Ищук С.А., Ахметшина А.О., Добровольская О.А., Федорова Е.А., Симбирцев А.С. Моноклональное антитело, специфичное к эпитопу белка p17 ВИЧ-1
3. Богомолова Е.Г., Духовлинов И.В., Добровольская О.А., Федорова Е.А., Ищук С.А., Симбирцев А.С. Способ получения активного начала вакцины против ротавирусной инфекции — белка FliCVP6VP8. Заявка №2017127940 от 03 авг 2017

1. И.В. Духовлинов, Е.Г. Богомолова, Е.А. Федорова, А.С. Симбирцев Создание гибридных рекомбинантных белков на основе белков VP6и VP8 ротавируса человека группы А/ Инфекция и иммунитет 2014, Т. 4, No 3, с. 229–234.
2. И.В. Духовлинов, Е.А. Федорова, Е.Г. Богомолова, О.А. Добровольская, Е.Н. Черняева, Р.И. Аль-Шехадат, А.С. Симбирцев Получение рекомбинантного белка CRM197 в клетках E.coli/Инфекция и иммунитет 2015, Т. 5, No 1, с. 37–44
3. И.В. Духовлинов, Е.Г. Богомолова, Е.А. Федорова, А.С. Симбирцев Изучение иммуногенности гибридных рекомбинантных белков на основе белков VP6 и VP8 ротавируса человека группы А/ Эпидемиология и Вакцинопрофилактика 2015, No 2 (81), с. 96-102.
4. И.В. Духовлинов, Е.А. Федорова, О.А. Добровольская, Е.Г. Богомолова, Е.Н. Черняева, Р.И. Аль-Шехадат, А.С. Симбирцев Получение рекомбинантного белка Tb4 Mycobacterium tuberculosis в клетках E.coli/Инфекция и иммунитет 2015, Т. 5, No 4, с. 315–322.
5. Е.Г. Богомолова, О.А. Добровольская, А.А. Мировская, Р.И. Аль-Шехадат, Е.А. Федорова, И.В. Духовлинов, А.С. Симбирцев Разработка кандидатной субстанции рекомбинантного белка CRM197/Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2016. №1 (86), Т. 15, с. 93-98.
6. И.В. Духовлинов, Е.Г. Богомолова, Е.А. Федорова, А.С. Симбирцев Исследование протективной активности кандидатной вакцины против ротавирусной инфекции на основе рекомбинантного белка FliCVP6VP8/ Медицинская иммунология. 2016, Т. 18, № 5, стр. 417-424.9.
7. Богомолова Е. Г., Духовлинов И.В., Фёдорова Е. А., Симбирцев А. С. Исследование протективной активности кандидатной вакцины против ротавирусной инфекции на основе рекомбинантного белка FliCVP6VP8/Медицинский академический журнал. 2016. Т. 16, №3, с. 391-393.
8. Малахов И.С.,  Аль-Шехадат Р.И., Духовлинов И.В., Симбирцев А.С. Создание иммуногена против вируса папилломы человека на основе химерного рекомбинантного белка L2E7 //Инфекция и иммунитет, 2016.-Т.6.-№4-С.345-352.
9. Богомолова Е.Г., Добровольская О.А., Федорова Е.А., Кондрашкина А.М., Колмаков Н.Н., Ищук С.А., Духовлинов И.В., Симбирцев А.С. Изучение антигенной активности экспериментальных образцов конъюгированных вакцин на основе синтетических олигосахаридных лигандов и белка-носителя CRM197/ Медицинская иммунология 2017, Т. 19, No 2, стр. 157-164.
10. Bogomolova E.G., Ishchuk S.A., Dobrovolskaya O.A., Federova E.A., Dukhovlinov I.V., Simbirtsev A.S. Study of Antigenic Activity of Experimental Samples of the Conjugated Vaccines Based on Synthetic Oligosaccharide Ligands and CRM197 Carrier Protein against Candida albicans, Aspergillus fumigatus and Pseudomonas aeruginosa/ Key Engineering Materials, 2017, Vol. 743, pp 349-354.

• Разработка новых пробиотических препаратов, изучение их свойств и механизмов действия.
• Инновационные работы в области конструирования метабиотиков — метаболитных и бактериально-метаболитных пробиотических препаратов, практически не имеющих мировых аналогов.
• Разработка и внедрение в практику препаратов для ремедиации почв и акваторий, загрязненных нефтепродуктами.
• Разработка методов культивирования генно-инженерных штаммов бактерий — продуцентов биологически активных рекомбинантных белков (интерферона, интерлейкинов, белков теплового шока и др.).
• Изучение процессов культивирования клеток эукариот (совместно с лабораторией иммунофармакологии института).
• Исследование метаболома физиологических жидкостей человека и животных при дисбиотических нарушениях и болезнях внутренних органов.
• Исследование генетических особенностей пробиотических штаммов бактерий.
• Получение и использование бактериальных пробиотиков на борту международной космической станции

• Идентификация, количественное определение, а также исследование биологических свойств экзометаболитов-регуляторов роста пробиотических и патогенных бактерий
• Разработка первых в России и в мире метаболитных препаратов «Актофлор» (лауреат ВВЦ, диплом первой степени ВВЦ, 1993 г.; медаль Недели высоких технологий, 2001 г.) и «Актофлор-С».
• В сотрудничестве с крупнейшим российским фармацевтическим заводом «Solopharm» в 2015 году налажено производство метабиотика нового поколения «Актофлор-С». http://actoflor.ru/
• Разработка собственного пробиотического препарата Витафлор®, симбиотического комплекса ацидофильных бактерий (золотая медаль им. И. И. Мечникова «За практический вклад в укрепление здоровья нации» РАЕН и Большая золотая медаль международного фонда биотехнологий им. акад. И. Н. Блохиной) и бактериально-метаболитного препарата «Витафлор-форте». Разработана технология и налажен промышленный выпуск препарата Витафлор®.
• Проведено широкомасштабное исследование механизмов действия пробиотического препарата Витафлор® и метабиотиков Актофлор и Актофлор-С.
• Совместно с кафедрой пропедевтики внутренних болезней СЗГМУ им. И. И. Мечникова начато широкомасштабное исследование метаболома крови у пациентов с язвенным колитом и целиакией в динамике на фоне применения метаболитного препарата «Закофальк», содержащего масляную кислоту и инулин. Результаты совместных исследований доложены на 8 международных конгрессах, опубликованы в нескольких рецензируемых журналах, индексируемых MedLine, Pubmed, Scopus и Web of Science, и отражены в Национальных рекомендациях по диагностике и лечению целиакии взрослых, утвержденных Российским научным медицинским обществом терапевтов (РНМОТ) в 2014 году.
• В 2015 году сотрудниками лаборатории и кафедры пропедевтики внутренних болезней СЗГМУ им. И. И. Мечникова впервые предложен ряд новых клинико-микробиологических концепций — концепция филометаболического ядра микробиоты, представляющего собой набор эволюционно стабильных видов микроорганизмов, отвечающих за большинство основных функций микробиоты, и концепция метаболического дисбиоза — особой формы дисбиоза кишечника, проявляющегося, прежде всего, метаболическими изменениями в организме человека (в сыворотке крови, моче, кале, выдыхаемомвоздухе) в результате нарушений микробного метаболизма. Авторами впервые описаны основные функциональные группы микроорганизмов филометаболического ядра микробиоты кишечника, обеспечивающие «ключевые» метаболические функции, а также ведущие характеристики самого филометаболического ядра.
• Совместно с ведущими учеными России под эгидой Научного общества гастроэнтерологов России (НОГР) и Российского научно-медицинского общества терапевтов (РНМОТ) продолжается разработка Национальных рекомендаций «Дисбиоз (дисбактериоз) кишечника: современное состояние проблемы, комплексная диагностика и лечебная коррекция».
• Идентификация и количественное определение экзометаболитов эукариотических культур клеток (клеток линии СНО – продуцентов БАВ).
• Совместно с ИФ им. И.П. Павлова исследовано действие экзометаболитов бактерий на культуры тканей высших организмови иммунитет лабораторных животных.
• Создана уникальная коллекция термофильных бактерий, выделенных из горячих источников Камчатки, Таджикистана и Узбекистана.
• Создана коллекция микроорганизмов-нефтедеструкторов (из экспедиций по Сибири) на основании которой разработаны препараты бактерий-нефтедеструкторов и технология ремедиации почв и акваторий, загрязненных нефтепродуктами.
• Проведено полногеномное секвенирование штаммов Lactobacillus acidophilus Д75 и Д76, входящих в состав пробиотического препарата Витафлор, идентифицированы гены бактериоцинов и изучена их экспрессия.

2000 год – Вербицкая Н.Б., Добролеж О.В., Кобатов А.И., Петров Л.Н. Сухой биопрепарат и способ его получения. Патент на изобретение № 2160992., 2000. Заявка: 99117491/13, 17.08.1999.
2006 год — Мельникова И.Ю., Петров Л.Н., Вербицкая Н.Б., Добролеж О.В., Кобатов А.И., Добрица В.П. Способ лечения воспалительных заболеваний желудочно-кишечного тракта, ассоциированных с Helicobacter pylori. Патент Российской Федерации № 2278682, 2006. Опубл. 27. 06.2006.Заявка: 2004112589/14, 27.04.2004. Дата начала отсчета срока действия патента: 27.04.2004.
2007 год – Вахитов Т.Я., Петров Л.Н., Шалаева О.Н., Бондаренко В.М. Стимулятор роста микроорганизмов «Полифлор» и препарат для лечения заболеваний желудочно-кишечного тракта. Патент на изобретение № 2291192 РФ, Б.и. №1 от 10.01.2007.
Ищенко А.И., Митрофанов Е.В.,Симбирцев А.С., Шалаева О.Н., Батарин В.И., Лисицкая В.И., Вахитов Т.Я., Петров Л.Н., Свентицкий Е.Н. Штамм Escherichia coli bl21 (de3)[pAYC-ET-(hIFN-α2b)-laci]-продуцент рекомбинантного человеческого альфа-2b интерферона и способ его культивирования. Патент Российской Федерации № 2303063, 2007. Опубл. 20.07.2007. Заявка: 2005130093/13, 29.09.2005. Дата начала отсчета срока действия патента: 29.09.2005.
2011 год– Гончар Н.В., Касснер Л.Н., Вахитов Т.Я., Петров Л.Н. Способ лечения больных подростков пневмонией. Патент на изобретение № 2414928, заявка № 2009107152от 03.03.2009, приоритет изобретения 27 февраля 2009 г. Зарегистрировано в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27 марта 2011 г. Опубликовано 27.03.2011 Бюл.№9.
2012 год– Вахитов Т.Я., Полевая Е.В., Шалаева О.Н. Средство, ингибирующее жизнедеятельность бактерий Escherichia coli O75 №5557 (ВАРИАНТЫ). Патент Российской Федерации № 2524138, 2014. Опубл. 27.07.2014, Бюл. № 21.Заявка: 2012140940/10, 26.09.2012. Дата начала отсчета срока действия патента:26.09.2012
2015 год – Вахитов Т.Я., Шалаева О.Н., Демьянова Е.В., Ситкин С.И. Средство, обладающее сочетанным нормализующим воздействием на иммунную и пищеварительную системы организма. Патент Российской Федерации № 2524138, 2014. Опубл. 27.07.2014, Бюл. № 21.Заявка: 2015110655/15, 26.03.2015. Дата начала отсчета срока действия патента: 26.03.2015

1. Вахитов Т.Я., Петров Л.Н. Выживаемость клеток Escherichiacoli при хранении в суспензиях различной концентрации // Микробиология. – 1992. – Т.61. – Вып.6. – С.1087-1095.
2. VakhitovT.Ya., Protasov E.A., Kulikov S.V., Petrov L.N., Korolyuk A.M. Growth autostimulators of bacteria with a wide range biological activity // Abstr. Intern. Conf. «Biotechnology St. Peterburg’94». – St.Petersburg, Russia, September 21-23, 1994. – P.78-79.
3. Вахитов Т.Я. Колебания численности бактерий в процессе голодания // Биофизика – 1999 .– Т.44. – Вып.3, С.503-504.
4. Глушанова Н.А., Вербицкая Н.Б., Петров Л.Н., Блинов А.И., Шендеров Б.А. Исследование ауто-, изо- и гомоантагонизма пробиотических штаммов лактобацилл // Бюллетень восточно-сибирского научного центра сибирского отделения российской академии медицинских наук. – 2005. — №6. – С. 138-142.
5. Вахитов Т.Я., Протасов Е.А, Виснольд Н.В, Толпаров Ю.Н., Петров Л.Н. Выделение и идентификация аутостимуляторов роста Escherichiacoli. // Журн. микробиол. – 2003.- №2 С.7-12. Вахитов Т.Я., Петров Л.Н. Регуляторные функции экзометаболитов бактерий // Микробиология.– 2006.– Т.75.- №4.– С.483-488.
6. Рыбальченко О.В., Бондаренко В.М., Вербицкая Н.Б. Ультраструктурные изменения в клетках shigella flexneri при взаимодействии с бактериоциногенными Lactobacillus acidophilus // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2006. — № 4. – С. 50-53.
7. Balykina N.A. ,VakhitovT.Ya. The effect of low-molecular bacterial metabolites on animal tissue cells proliferation // II International symposium «Interaction of the nervous and immune systems in health and disease» June 16-June 19, 2009, Saint Peterburg, Russia, Abstracts, p.10.
8. Вахитов Т.Я., Чалисова Н.И., Балыкина Н.А., Петров Л.Н., Ноздрачев А.Д. Модулирующее влияние метаболитов микрофлоры человека и животных на культуру лимфоидной ткани // Доклады Академии наук.– 2009.– Т.428.- №1.– С.121-124.
9. Гончар Н.В., Березина Л.В., Тихомирова О.В., Добролеж О.В., Вербицкая Н.Б., Петров Л.Н., Бондаренко В.М. Выбор пробиотика для рациональной терапии клебсиеллезной инфекции у детей // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2009. — №2. – С. 85-89.
10. Polevaya E.V., VakhitovT.Ya. Non-specialized low-molecular exogenous metabolites as regulators of quorum sensing in bacteria. //1st European Student Conference on Microbial Communication 2010 (MiCom 2010) September 28 — October 1, 2010 Jena, Germany. Abstractbook.– P.9.
11. Гончар Н.В., Касснер Л.Н., Коренев П.Б., Илькович Ю.М., Могилина С.В., Петров Л.Н., Вахитов Т.Я. Микробные и метаболитныепробиотики как средства повышения эффективности лечения внебольничной пневмонии у подростков // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология, 2011. – № 1. – С. 78-84.
12. Вербицкая Н.Б., Кобатов А.И., Петров А.И., Петров Л.Н. Особенности получения и использования бактериальных пробиотиков на борту международной космической станции в условиях длительных космических экспедиций // Космонавтика и ракетостроение. – 2011. — №3(64). – С. 130-135.
13. Полевая Е.В., ВахитовТ.Я., Яковлева Е.П. Штаммоспецифические особенности в составе и динамике карбоновых кислот при выращивании бактерий Escherichia coli и Salmonella enteritidis // Научный журнал КубГАУ, — 2012 — №77(03), http://ej.kubagro.ru/2012/03/pdf/49.pdf
14. Вахитов Т.Я, Чалисова Н.И., Полевая Е.В., Линькова Н.С., Хавинсон В.Х. Регуляторные функции аминокислот и их сочетаний упрокариот и в тканях высших организмов // Успехи современной биологии. – 2012.– Том 132.-№6.- С.594-600.
15. Полевая Е.В., Вахитов Т.Я., Шалаева О.Н., Берсон Ю.М. Сравнительный анализ состава и динамики аминокислот, выделяемых бактериями в среду культивирования на примере выращивания Escherichia coli и Salmonella enteritidis // Научный журнал КубГАУ – Краснодар: КубГАУ, 2012. – №06(80). – Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2012/06/pdf/38.pdf
16. Ситкин С.И., Ткаченко Е.И., Вахитов Т.Я., Орешко Л.С., Жигалова Т.Н. Метаболом сыворотки крови по данным газовой хроматографии – масс-спектрометрии (ГХ-МС) у пациентов с язвенным колитом и больных целиакией // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2013. – № 12. – С. 77–90.
17. Sitkin S., Tkachenko E., Vakhitov T., Oreshko L., Zhigalova T. Serum metabolome in mild-moderate active ulcerative colitis and celiac disease // United European Gastroenterology Journal. – 2013. – Volume 1 (Supplement 1) 1 (1S). – P. A508 (P1397).
18. Sitkin S., Tkachenko E., Vakhitov T., Oreshko L., Zhigalova T. Oral butyrate plus inulin improve serum metabolomics profile and gut microbiota composition in ulcerative colitis and celiac disease // Journal of Crohn’s & Colitis. – 2014. – Vol. 8, Suppl. 1. – P. S232 (P399).
19. Vakhitov T.Ya., Utsal V.A., Sitkin S.I., Chernyaeva E.V., Egorova T.S. Study of the mechanisms of probiotic activities by of the blood samples from experimental animals using metabolome analysis // Russian Journal of Infection and Immunity (Infektsiaiimmunitet).– 2014.– September.– Specialissue.–p.59. Материалы. XVIII Международный симпозиум по гнотобиологии. III Санкт-Петербургский международный экологический форум «Окружающая среда и здоровье человека: фундаментальные, клинические и экологические аспекты современной микробиологии» 21-24 сентября 2014 г. Санкт-Петербург.
20. Вахитов Т.Я., Ситкин С.И. Концепция суперорганизма в биологии и медицине // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2014. – № 7 (107). – С. 72–85.
21. Ситкин С.И., Ткаченко Е.И., Вахитов Т.Я. Филометаболическое ядро микробиоты кишечника // Альманах клинической медицины. 2015 Август-сентябрь; №40: С. 12–34
22. Seliverstov P.V., Sitkin S.I., Radchenko V.G., Vakhitov T.Y., Shavarda A.L. changes in the intestinal microflora and its metabolites in patients with non-alcoholic fatty liver disease //EuromedicainternationalermedizinischerKongress. Hannover 2015, 26-27 mai 2015,Programm Abstracts p.81-83
23. S. Sitkin, T. Vakhitov, E. Tkachenko, L. Oreshko, T. Zhigalova. Metabolic dysbiosis concept and its biomarkers in ulcerative colitis and celiac disease // Abstracts of the 10th Congress of ECCO — European Crohn’s and Colitis Organisation. Barcelona, Spain, February 18-21, Journalof Crohn’s and Colitis 2015.– V. 9.– SuppI.1.–p. S437.
24. Вахитов Т.Я., Чалисова Н.И., Ситкин С.И. Влияние карбоновых кислот – метаболитов микробиоты кишечника на пролиферативную активность клеток организма хозяина в органотипических культурах тканей // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2015. – № 12 (123). – С. 73–82.
25. Ситкин С.И., Ткаченко Е.И., Вахитов Т.Я. Метаболический дисбиоз кишечника и его биомаркеры // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2015. – № 12 (123). – С. 6–29.
26. Vakhitov T., Chalisova N., Sitkin S. Effect of carboxylic acids of gut microbial origin on host cell proliferation in organotypic tissue cultures // J Crohns Colitis. 2016; 10(Suppl 1):S492. doi: 10.1093/ecco-jcc/jjw019.874.
27. Вахитов Т.Я. 40 лет лаборатории микробиологии Гос. НИИ особо чистых биопрепаратов // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология.– 2015.– №12 (124).– С. 129–132
28. Торопов В.А., Шалаева О.Н., Рощина Е.К., Вахитов Т.Я., Ситкин С.И. Выявлениегенов бактериоцинов у пробиотическихштаммовмолочнокислыхбактерий Lactobacillus acidophilus Д № 75 и Lactobacillus acidophilus Д № 76 // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2016. – № 10 (134). – С. 58–65.
29. Ситкин С.И., Вахитов Т.Я., Ткаченко Е.И., Орешко Л.С., Жигалова Т.Н., Радченко В.Г., Селиверстов П.В., Авалуева Е.Б., Суворова М.А., Комличенко Э.В. Изменения микробиоты кишечника при язвенном колите и целиакии и их коррекция с помощью метабиотиков // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2016. – № 12 (136). – С. 6–20.
30. Seliverstov P.V., Prikhodko E.M., Sitkin S.I., Radchenko V.G., Vakhitov T.Y., Shavarda A.L. The role of intestinal microbiocenosis and exometabolites of microbiota in the development, course and prognosis of nonalcoholic fatty liver disease // Abstracts of the International Congress EuroMedica Hannover 2016 “ModerneAspekte der Prophylaxe, Behandlung und Rehabilitation” (“Modern Aspects of Prophylaxis, Treatment and Rehabilitation”) (Hannover, Germany, 24–25 May 2016). – 2016. – P. 68–69. ISBN 978-3-00-034634-7 ISSN 2194-3524
31. Sitkin S., Tkachenko E., Vakhitov T., Oreshko L., Zhigalova T., Suvorova M. Taxonomic and metabolic dysbiosis in patients with ulcerative colitis and coeliac disease. Abstracts of 26th ECCMID Congress, the European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. Amsterdam, Netherlands, 9–12 April, 2016. ESCMID eLibrary. ePoster Presentation No. EP0192.
32. Вахитов Т.Я., Чалисова Н.И., Ситкин С.И., Салль Т.С., Шалаева О.Н., Демьянова Е.В., Моругина А.С., Виноградова А.Ф., Петров А.В., академик Ноздрачёв А. Д. Низкомолекулярные компоненты метаболома регулируют пролиферативную активность в клеточных и бактериальных культурах // Доклады Академии наук.– 2017.– Т.472.- №4.

• Разработка технологии и получение инновационных форм сорбентов для хроматографического выделения биоактивных веществ
• Разработка инновационных лекарственных форм на основе микродисперсных препаратов хитозана и целлюлозы
• Структурный спектральный анализ и доклинические исследования нанодисперсных форм препаратов
• Разработка методов тераностики онкологических заболеваний человека на основе использования наноразмерных магнитных и флуресцирующих материалов
• Исследование метаболома человека и животных при патофизиологических нарушениях и болезнях внутренних органов методами ненарушающего спектрального анализа и магнитно-резонансной томографии
• Исследование метаболома микроорганизмов методами неинвазивного радиоспектрального анализа
• Oбъекты исследования:
  — нано и микросферические носители лекарственных средств белков и пептидов
  — гибридные иммунотерапевтические препараты нанодисперсной структуры на основе рекомбинантных белков антагониста интерлейкина 1, белка теплового шока Hsp70 и интерферона
  — адресные магнитные конъюгаты на основе оксидов металлов Fe, Co, Ni и рецепторных биолигандов для целей визуализации томографических изображений, направленной магнитной фокусировки противораковых препаратов, местного лечения наружных поражений кожи
  — адресные конъюгаты квантовых точек с биолигандами в форме цитокинов и антител к рецепторам мембран трансформированных клеток

• Синтезированы гибридные магнитные наночастицы оксида железа с декстраном и целлюлозой для неинвазивной диагностики методом МРТ при внутривенном, пероральном и интратрахеальном введении.
• Синтезированы кандидатные конъюгаты негативного контрастирующего действия суперпарамагнитных наночастиц оксида железа с аллофероном, интерфероном альфа 2в, эпидермальным фактором роста, белком теплового шока Hsp70 и рецепторным антагонистом интерлейкина 1 бета.
• Синтезированы наносферические частицы хитозана в качестве носителя антибиотиков для интраназальной и перорально аппликации
• Получены опытные образцы препаратов микросферической целлюлозы для сорбционной очистки белков от пирогенных эндотоксинов лекарственных средств с высокой тропностью к бактериальным липополисахаридам.

 

1. Богачев Ю.В., Фролов В.В., Черненко Ю.С., Марченко Я.Ю. Магниторезонансный томограф с переносом намагниченности. Патент № 113849 от 27.02.2012.
2. Николаев Б.П., МарченкоЯ.Ю., Яковлева Л.Ю.Контрастное средство для магнитно-резонансной томографии. Патент № 2465010 от 27.10.2012.
3. Марченко Я.Ю Богачев Ю.В., Фролов В.В., Черненко Ю.С., Магниторезонансный томограф с динамической поляризацией ядер. Патент № 114158 от 10.03.12.

1. Nikolaev B.P., Yakovleva L.Yu., Mikhalev V.A., Marchenko Ya.Yu., Gepetskaya M.V., Ischenko A.M., Slonimskaya S.I. and Simbirtsev A.S. (2012). The Inflammatory Response of Respiratory System to Metal Nanoparticle Exposure and Its Suppression by Redox Active Agent and Cytokine Therapy, Recent Trend in Electrochemical Science and Technology, Ujjal Kumar Sur (Ed.), ISBN: 978-953-307-830-4, InTech, Available from:http://www.intechopen.com/articles/show/title/the-inflammatory-response-of-respiratory-system-to-metal-nanoparticle-exposure-and-it-s-suppression-
2. Maxim A Shevtsov, Boris P Nikolaev, Liudmila Y Yakovleva, Marina A Parr, Yaroslav Y Marchenko, Igor Eliseev, Anatolii V Dobrodumov, Olga Zlobina, Alexander Zhakhov, Alexander M Ischenko, Emil Pitkin, Gabriele Multhoff. 70-kDa heat shock protein coated magnetic nanocarriers as a nanovaccine for induction of anti-tumor immune response in experimental glioma. Journal of Controlled Release 11/2015; 220(Pt A). DOI:10.1016/j.jconrel.2015.10.051. P. 329-340. 7.71 Impact Factor.
3. Maxim A. Shevtsov, Boris P. Nikolaev, Vyacheslav A. Ryzhov, Ludmila Y. Yakovleva, Anatolii V. Dobrodumov, Yaroslav Y. Marchenko, Boris A. Margulis, Emil Pitkin, Irina V. Guzhova. Brain tumor magnetic targeting and biodistribution of superparamagnetic iron oxide nanoparticles linked with 70-kDa heat shock protein study by nonlinear longitudinal response. Journal of Magnetism and Magnetic Materials 08/2015; 388. p.123-134. DOI:10.1016/j.jmmm.2015.04.030. 1.97 Impact Factor.
4. Maxim Shevtsov, Boris Nikolaev, Vyacheslav Ryzhov, Liudmila Yakovleva, Yaroslav Marchneko, Marina Parr, Anastasiya Mikhrina, Anatolii Dobrodumov, Emil Pitkin, Gabriele Multhoff. Ionizing radiation improves glioma-specific targeting of superparamagnetic iron oxide nanoparticles conjugated with cmHsp70.1 monoclonal antibodies (SPION-cmHsp70.1) Nanoscale 01/2015; DOI:10.1039/C5NR06521F. 7.39 Impact Factor.
5. M.A Shevtsov, B.P. Nikolaev, L.Y. Yakovleva, A.V.Dobrodumov, A.V. Zhakhov, A.L. Mikhrina, E.Pitkin, M.A. Parr, V.I.Rolich, A.S.Simbircev, A.M.Ischenko. Recombinant interleukin-1 Receptor Antagonist Conjugated to Superparamagnetic Iron Oxide Nanoparticles to Theranostic Targerting of Experimental Glioblastoma. Neoplasia, 2015, 17(1), 32-42. 7 Impact Factor
6. Nikolaev B.P., Marchenko Ya.Yu., Yakovleva L.Yu., Zimina T.M., Soloviev A.V., Luchinin

• Изучение острой и хронической токсичности, оценка раздражающего действия и пирогенности лекарственных средств.
• Изучение аллергенности и иммунотоксичности лекарственных средств.
• Изучение репродуктивной токсичности лекарственных средств.
• Изучение специфической фармакологической активности лекарственных средств на релевантных моделях заболеваний и патологических состояний.
• Изучение фармакокинетики и биораспределения лекарственных средств.

• В лаборатории созданы новые и воспроизведены известные экспериментальные модели целого ряда социально значимых заболеваний, таких как ревматоидный артрит, бронхиальная астма, язвенные поражения желудка и 12-перстной кишки, атеросклероз коронарных сосудов, инфицированная кожная рана, язвенное поражение кожи, модели артериального и венозного кровотечения. Список имеющихся моделей постоянно расширяется, что позволяет проводить оценку специфической активности практически любых типов лекарственных препаратов.
• Лаборатория располагает обширной материально-технической базой, а также виварными и лабораторными помещениями позволяющими проводить работы в соответствии с принципами GLP и рекомендациями МЗ РФ.

Текст

Текст

Текст

Текст

Изучение молекулярной вирусологии ВИЧ/СПИД и разработка вакцины против ВИЧ

• С момента образования лаборатории в 1987 г. в институте развивается направление по разработке вакцины против ВИЧ. Сотрудниками лаборатории являются высококвалифицированные ученые, имеющие большой опыт в молекулярной эпидемиологии и вирусологии ВИЧ, молекулярной биологии и генной инженерии, иммунологии и клеточной биологии.
  В 1987 году сотрудниками лаборатории зарегистрированы первые в СССР случаи ВИЧ-инфекции, а в 1988 году первый случай смерти от СПИДа.
• В 1990 году получены первые отечественные изоляты вируса иммунодефицита человека и проклонированы их полные геномы.
• В 2010 году при изучении острой и ранней ВИЧ-инфекции было сделано важное открытие мирового значения о высокой гомогенности вирусной популяции в организме недавно заразившихся наркозависимых, свидетельствующее о том, что в большинстве случаев (70%) заражение происходит одной единственной вирусной частицей или идентичными частицами, против которых и следует разрабатывать вакцину против ВИЧ.
• Лаборатория была инициатором разработки федеральной программы «Вакцины нового поколения и медицинские диагностические системы будущего» в 1997 году, в составе которой было отдельное направление по разработке вакцины против ВИЧ. В рамках данного проекта сотрудниками лаборатории совместно с Биомедицинским центром была разработана кандидатная ДНК-вакцина против ВИЧ-1 «ДНК-4», организован производственный участок для наработки и анализа ДНК-вакцины.
• Вакцина «ДНК-4» успешно прошла I фазу клинических испытаний на здоровых добровольцах в 2008-2010 гг., продемонстрировав высокий профиль безопасности, отсутствие местной и системной токсичности и серьёзных побочных явлений. Было показано, что вакцина является иммуногенной и вызывает индукцию преимущественно клеточного иммунного ответа у всех вакцинированных участников клинических испытаний.
• В 2013-2016 гг. лаборатория участвовала в проведении II фазы клинических испытаний кандидатной терапевтической вакцины против ВИЧ. Это первые испытания терапевтической вакцины против ВИЧ II фазы в России. Клинические испытания были успешно завершены, в них принимали участие Биомедицинский центр, ФГУП «Гос.НИИ ОЧБ» ФМБА России, компания ИФАРМА и 9 центров СПИД из различных регионов страны.
• В ходе II фазы клинических испытаний была показана безопасность и хорошая переносимость вакцины «ДНК-4» для ВИЧ-инфицированных пациентов, принимающих высокоактивную антиретровирусную терапию первой линии. Показано возможное влияние вакцинации на латентные вирусные резервуары, что свидетельствует о перспективности ее дальнейших испытаний.
  В настоящее время ведется работа по организации новой программы по разработке вакцины против ВИЧ.

Текст

1. Российский патент. Способ диагностики онкологических заболеваний. Круковская Л.Л., Полев Д.Е., Носова Ю.К., Баранова А.В., Козлов А.П.
Номер 2340896
Дата приоритета 2008.12.18
2. Российский патент. Экспрессионная плазмидная ДНК pBMC-nef(A)-hum.
Козлов А.П., Климов Н.А., Мурашев Б.В., Духовлинов И.В., Астанина М.С., Машарский А.Э.
Номер 2335540
Дата приоритета 2006.12.25
3. Российский патент. Экспрессионная плазмидная ДНК pBMC-gag(A)-hum
для экспрессии белка p55 ВИЧ-1 в клетках эукариот. Козлов А.П., Климов Н.А., Мурашев, Б.В., Духовлинов И.В., Астанина М.С., Машарский А.Э.
Номер 2345138
Дата приоритета 2006.12.25
4. Российский патент. Рекомбинантная плазмидная ДНК pBMC-RT(A)-hum
для экспрессии белка обратной транскриптазы вируса иммунодефицита человека. Козлов А.П., Климов, Н.А., Мурашев Б.В., Духовлинов И.В., Астанина М.С., Машарский А.Э.
Номер 2355764
Дата приоритета 2006.12.25
5. Российский патент. Экспрессионная плазмидная ДНК pBMC-gp140(A)
hum. Козлов А.П., Климов Н.А., Мурашев Б.В., Духовлинов И.В., Астанина М.С., Машарский А.Э.
Номер 2346044
Дата приоритета 2006.12.25
6. Российский патент. Способ получения антител к белку р17 ВИЧ. Аль-
Шехадат Р.И., Духовлинов И.В., Климов Н.А., Петров А.В., Симбирцев А.С., Козлов А.П.
Номер 2412946
Дата приоритета 2009.11.03
7. Российский патент. Рекомбинантный иммуноген для иммунизации
против белка р17 вируса иммунодефицита человека. Козлов А.П., Климов Н.А., Духовлинов И.В., Аль-Шехадат Р.И.
Номер 2008149816/13(065371)
Дата приоритета 2008.12.18

Текст

• Изучение иммунофармакологии и механизмов действия цитокинов, природных и синтетических биологически активных соединений.
• Исследование роли иммунной системы в развитии заболеваний человека.
• Разработка научных основ клинического применения лекарственных препаратов цитокинов и других физиологически значимых молекул.
• Разработка биотехнологических методов создания генноинженерных биопрепаратов, рекомбинантных вакцин, гуманизированных моноклональных антител.
• Разработка новых подходов к цитокиновой и антицитокиновой иммуномодулирующей терапии.

• При непосредственном участии сотрудников лаборатории создан и внедрен в медицинскую практику генно-инженерный препарат «Беталейкин» на основе рекомбинантного интерлейкина-1b. Работа «Конструирование бактериальных продуцентов, организация биотехнологического производства субстанций и препаратов на основе рекомбинантных цитокинов человека и внедрение в практику разработанного медицинского препарата «Беталейкин» удостоена премии Правительства РФ в области науки и техники за 2006 г.
• Сотрудники лаборатории принимали участие в разработке и внедрении в клиническую практику иммуномодулирующего препарата «Бестим» на основе синтетического дипептида гамма-Glu-Trp, аэрозольного лекарственного препарата рекомбинантного интерферона альфа 2b, препарата для лечения аутоиммунных заболеваний на основе рекомбинантного рецепторного антагониста ИЛ-1.
• В последние годы разработана технологическая платформа по созданию высокопроизводительных штаммов-продуцентов рекомбинантных белков для медицинского применения на основе клеток млекопитающих, включающая экспрессионные плазмиды, обеспечивающие интенсивную продукцию и стабильность экспрессии белков, а также линии эукариотических клеток-продуцентов, адаптированные к суспензионному культивированию в бессывороточной среде с химически определенным составом. Это обеспечивает эффективный синтез биологически активных молекул с направленным действием и низкой токсичностью, а также позволяет достичь масштабирования процесса для промышленного выпуска разработанных лекарственных препаратов. С использованием данной научной платформы созданы штаммы-продуценты рекомбинантных гликопротеинов, в том числе, терапевтических моноклональных антител, на основе которых разрабатываются технологии получения активных субстанций оригинальных и воспроизведенных биопрепаратов для медицинского использования.

Защищены:
1 докторская диссертация: Варюшина Елена Анатольевна – «Провоспалительные цитокины в регуляции процессов воспаления и репарации» — 2013 г.
4 кандидатские диссертации:
Котов А.Ю. — “Разработка диагностических тест-систем и их использование для изучения продукции провоспалительных цитокинов при воспалительных процессах”, 1999 г.
Пигарева Н.В. – «Изучение иммуностимулирующего действия синтетического дипептида гамма-D-глутаминил-L-триптофана (Бестима), 2000 г.
Петров А.В. — «Изучение влияния γ-D-глутамил-L-триптофана (Бестима) на дифференцировку и функциональную активность Т-лимфоцитов» — 2007 г.
Александров Георгий Вячеславович – «Изучение воздействия рекомбинантного интерлейкина-1 бета человека на заживление осложненной кожной раны и язвы желудка» — 2013 г.

Текст

1. Е.А. Варюшина, Г.В. Александров, Т.А. Сазонова, А.С. Симбирцев Изучение влияния местного применения рекомбинантного человеческого интерлейкина 1β на репарацию язвенных повреждений слизистой оболочки желудка // Цитокины и воспаление. 2012, Т. 11, № 1. С.64-69
2. Tseilikman V., Kozochkin D., Synitsky A., Sibiriak S., Tseilikman O., Katashinsky E., Nikitina A., Vinogradov D., Simbirtsev A. Does Stress-Induced Release of Interleukin-1 Cause Liver Injury? // Cell. Mol. Neurobiol., 2012., V.32, P.1069–1078
3. Зурочка А.В., Суховей Ю.Г., Зурочка В.А., Добрынина М.А., Костоломова Е.Г., Колобов А.А., Симбирцев А.С. Дозозависимые эффекты антибактериального действия синтетического пептида активного центра GM-CSF // Инфекция и иммунитет.-2012.-Т.2.-№3.-С.657-660
4. Петров А.В., Пигарева Н.В., Колобов А.А., Симбирцев А.С. Изучение иммуномодулирующих свойств N-концевого пептида растворимого фактора, ингибирующего иммунный ответ // Цитокины и воспаление.-2012.-Т.11.-№2.-С.90-95
5. Трофимов А.Н., Зубарева О.Е., Симбирцев А.С., Клименко В.М.
Влияние неонатальных повышений уровня интерлейкина-1β на формирование пространственной памяти взрослых крыс // Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова.-2012.-Т.98.-№6.-С.782-792.
6. Петров А.В., Пигарева Н.В., Мурашев Б.В., Карасев М.М., Симбирцев А.С. Адаптация клеток линии CHO-K1 к суспензионному культивированию в коммерческих бессывороточных средах // Биотехнология.-2012.-№ 2.-С.50-58.
7. Симбирцев А.С. Достижения и перспективы использования рекомбинантных цитокинов в клинической практике // Медицинский Академический Журнал.-2013.-Т.13.-№1.-С.7-22
8. Пигарева Н.В., Петров А.В., Колобов А.А., Симбирцев А.С. Стимулятор пролиферации регуляторных Т-лимфоцитов и способ их стимуляции // Патент РФ № 2499043 от 20.11.2013. Приоритет от 26.09.2013.
9. Исаев А.В., Кетлинский С.А., Симбирцев А.С. Пептид, обладающий антиатеросклеротическим действием, и композиция для профилактики и лечения атеросклероза сосудов // Патент РФ № 2495048 от 10.10.2013. Приоритет от 18.04.2012.
10. Симбирцев А.С. Цитокины в патогенезе инфекционных и неинфекционных заболеваний человека // Медицинский Академический Журнал.-2013.-Т.13.-№3.-С.18-41
11. Zubareva O.E., Shcherbakova K.P., Klimenko V.M., Kalemenev S.V., Simbirtsev A.S. Impairments to conditioned reflex activity in adult rats after administration of interleukin-1β during early postnatal ontogeny // Neuroscience and Behavioral Physiology.-2013.-V.43.-№ 2.-P. 210-213.
12. Гребенюк А.Н., Аксенова Н.В., Петров А.В., Аль-Шехадат Р.И., Климов Н.А., Симбирцев А.С. Получение различных вариантов рекомбинантного флагеллина и оценка их радиозащитной эффективности // Вестник Российской военно-медицинской академии.-2013.-№ 3 (43).-С.75-80.
13. Аль-Шехадат Р.И., Матюнина Е.А., Шарафутдинова Т.А., Козлов А.П., Климов Н.А., Петров А.В., Симбирцев А.С. Штамм бактерий Escherichia coli – продуцент рекомбинантного флагеллина // Патент РФ № 2524133 от 30.05.2014. Приоритет от 15.11.2012.
14. Горелов А.И., Симбирцев А.С., Сереженков А.В., Петров А.В. Иммунотерапия пациентов с хроническим пиелонефритом в активной фазе воспаления // Вестник Санкт-Петербургского университета. Серия 11: Медицина. 2014.-№ 3.-С.118-126.
15. Духовлинов И.В., Богомолова Е.Г., Федорова Е.А., Симбирцев А.С. Создание гибридных рекомбинантных белков на основе белков VP6 и VP8 ротавируса человека группы А // Инфекция и иммунитет.-2014.-Т.4.-№ 3.-С.229-234.
16. Trofimov A.N., Zubareva O.E., Klimenko V.M., Simbirtsev A.S. Effects of neonatal increases in interleukin-1β levels on the formation of spatial memory in adult rats // Neuroscience and Behavioral Physiology.-2014.-Т.44.-№ 3.-С.359-364.
17. Пигарева Н.В., Трофимов А.В., Родин С.В., Жахов А.В., Ищенко А.М., Петров А.В., Климов Н.А., Симбирцев А.С. Моноклональное антитело против интерлейкина-6 человека и гибридома, продуцирующая данное моноклональное антитело // Патент РФ № 2550262 от 10.05.2015. Приоритет от 28.02.2014.
18. Радаева О. А., Симбирцев А. С. Взаимосвязь сывороточных уровней и полиморфных вариантов генов IL-1β, IL-1α, IL-1RA с риском развития инфаркта миокарда и острого нарушения мозгового кровообращения при эссенциальной гипертензии (ЭАГ) // Российский иммунологический журнал.-2015.-Т.9.-№ 3.-С.173-175
19. Серёженков А.В., Симбирцев А.С., Горелов А.И., Петров А.В., Колобов А.А. Клинико-иммунологическое исследование эффективности применения γ-D-Glu-L-Trp у пациентов с хроническим пиелонефритом // Цитокины и воспаление.-2015.-Т.14.-№2.-С.77-83
20. Радаева О.А., Симбирцев А.С. Клинико-патогенетические особенности взаимодействия системы интерлейкина-1 и классических вазопрессорных факторов у больных эссенциальной артериальной гипертензией // Цитокины и воспаление.-2015.-Т.14.-№3.-С.83-89
21. Духовлинов И.В., Федорова Е.А., Богомолова Е.Г., Добровольская О.А., Черняева Е.Н., Аль-Шехадат Р.И., Симбирцев А.С. Получение рекомбинантного белка CRM197 в клетках E.coli // Инфекция и иммунитет.-2015.-Т.5.-№ 1.-С.37-44.
22. Стагниева И.В., Симбирцев А.С. Значение цитокинового профиля в проявлении болевого симптома при риносинусите // Цитокины и воспаление.-2015.-Т.14.-№4.-С.29-34
23. Духовлинов И.В., Федорова Е.А., Добровольская О.А., Богомолова Е.Г., Черняева Е.Н., Аль-Шехадат Р.И., Симбирцев А.С. Получение рекомбинантного белка TB10.4 Mycobacterium tuberculosis в клетках Escherichia coli // Инфекция и иммунитет.-2015.-Т.5.-№ 4.-С.315-322.
24. M.A.Shevtsov, B.P. Nikolaev, L.Ya.Yakovleva, A.V.Dobrodumov, A.V.Zhakhov, A.L.Mikhrina, E.Pitkin, M.A.Parr, V.I.Rolich, A.S.Simbirtsev, A.M.Ischenko. Recombinant interleukin-1 receptor antagonist conjugated to superparamagnetic iron oxide nanoparticles for theranostic targeting of experimental glioblastoma.//Neoplasia, 2015.-Vol.17.-N.1.-P.32-42.
25. Zubareva O.E., Schwartz A.P., Khnychenko L.K., Ishchenko A.M., Simbirtsev A.S., Klimenko V.M. Behavioral, hormonal, and neurotransmitter reactions to stress in adult rats with a history of high IL-1β content in the early postnatal ontogeny // Bulletin of Experimental Biology and Medicine.- 2015.-158(5):607-610
26. Богомолова Е.Г., Добровольская О.А., Мировская А.А., Аль-Шехадат Р.И., Федорова Е.А., Духовлинов И.В., Симбирцев А.С. Разработка кандидатной субстанции рекомбинантного белка CRM197 // Эпидемиология и вакцинопрофилактика.-2016.-Т.15.-№ 1 (86).-С.93-98.
27. Кондратьева Е.В., Нимирицкий П.П., Петров А.В., Симбирцев А.С. ДНК, кодирующая полноразмерный антагонист рецептора интерлейкина-36 человека, ДНК, кодирующая полноразмерный антагонист рецептора интерлейкина-36 человека с С-концевым полигистидиновым тагом, плазмидный экспрессионный вектор (варианты), штамм бактерий Escherichia coli BL21 STAR[DE3] (PET-IL36RAF) – продуцент полноразмерного рецепторного антагониста интерлейкина-36 и штамм бактерий Escherichia coli BL21 STAR[DE3] (PET-IL36RAF-HIS) – продуцент полноразмерного рецепторного антагониста интерлейкина-36 с С-концевым полигистидиновым тагом // Патент РФ № 2582569 от 04.04.2016. Приоритет от 24.07.2014.
28. Духовлинов И.В., Богомолова Е.Г., Федорова Е.А., Симбирцев А.С. Исследование протективной активности кандидатной вакцины против ротавирусной инфекции на основе рекомбинантного белка FliCVP6VP8. Медицинская иммунология. 2016;18(5):417-424.
29. Ищенко А.М., Кудлинг Т.В., Петров А.В., Пигарева Н.В., Протасов Е.А., Симбирцев А.С. Синтетическая ДНК, кодирующая интерлейкин-7 человека, содержащий её экспрессионный вектор (варианты), штамм-продуцент интерлейкин-7 человека и способы получения интерлейкин-7 человека // Патент РФ № 2615447 от 04.04.2017. Приоритет от 13.11.2015.
30. Петров А.В., Карасев М.М., Кудлинг Т.В., Пигарева Н.В., Сергеева В.Е., Трофимов А.В., Ищенко А.М., Горбунов А.А., Вахрушев А.В., Симбирцев А.С. Синтетическая ДНК, кодирующая антимюллеров гормон человека, содержащий её экспрессионный вектор pTVK4pu/MISOPT и штамм клеток яичников китайского хомячка CHO-MIS — продуцент рекомбинантного антимюллерового гормона человека // Патент РФ № 2616273 от 13.04.2017. Приоритет от 21.04.2016.

• электронно-микроскопическое исследование микроорганизмов различных таксономических групп: бактерий, вирусов, простейших и микроскопических грибов, а также тканей макроорганизма в норме и при патологии;
• исследование влияния факторов космического полета на биопленки пробиотических бактерий, развивающиеся на основе различных носителей (Долгосрочный Проект с ОАО «Биохиммаш»: «Исследование закономерностей формирования бактериальных биоплёнок в условиях микрогравитации». Шифр «Биоплёнка». С 2013 года – по настоящее время);
• исследование влияние липополисахаридов на барьерные свойства эпителия и транслокацию пробиотических бактерий в лимфу и системный кровоток;
• исследование бактерицидного эффекта и регенерации кожных ран при воздействии холодной плазмы атмосферного давления.
• Аналитическая приборная база лаборатории включает:
  — Сканирующий электронный микроскоп JSM-35C (JEOL, Япония),
  — Просвечивающий электронный микроскоп JEM 100C (JEOL, Япония), ультратомы,
  напылительные установки и т.д.

Общее количество опубликованных работ – 136.
Общее количество публикаций в базах данных РИНЦ – 87.
Общее количество публикаций в базах данных WebofScienceCoreCollection –6.
Общее количество публикаций в базах данных Scopus – 39.
ИндексХирша (по Scopus) — 5.
ИндексХирша (по Web of Science Core Collection) — 4.
Индекс Хирша (согласно данным РИНЦ) – 9.
Наиболее значимые публикации
За последние 5 лет (2012-2016 гг) 10 статей в базах данных Scopus:
1. Бондаренко В.М., Рыбальченко О.В., Орлова О.Г., Фиалкина С.В. Деструкция лактобацилл под действием бактериоциноподобных ингибирующих субстанций Staphylococcus aureus.- Журн. Микробиол.. 2012, №2, с.3-8.
2. О.В.Рыбальченко, В.М.Бондаренко, Е.Л.Фальчук, Ю.А.Лебедькова, А.Г.Марков Действие холерогена и протамина на плотные контакты энтероцитов и колоноцитов крыс.- Журн. Микробиол.. 2012, №6, с. 3-7.
3. О.В.Рыбальченко, О.Г.Орлова, В.М. Бондаренко Антимикробные пептиды лактобацилл // Журн. Микробиол., 2013, №4, с. 89-100.
4. Markov A.G.,Falchuk E.L.,Kruglova N.M., Rybalchenko O.V., Fromm M., Amasheh S. Comparative analysis of theophylline and cholera toxin in rat colon reveals an induction of sealing tight junction proteins // Pflugers Archiv European Journal of Physiology, 2014. 466(11): 2059-65.
5. В.М. Бондаренко, О.В. Рыбальченко Анализ профилактического и лечебного действия пробиотических препаратов с позиций новых научных технологий. Журн. Микробиол. 2015. №2, с. 90-104.
6. O. V. Rybalchenko, V. M. Bondarenko, O. G. Orlova, A. G. Markov, S. Amasheh Inhibitory effects of Lactobacillus fermentum on microbial growth and biofilm formation. Archives of Microbiology 2015. V.197, №8, p. 1027-32.
7. О.В. Рыбальченко, О.М. Степанова, О.Г. Орлова, А.М. Астафьев, А.А. Кудрявцев, В.В. Капустина Влияние импульсно-периодического коронного разряда на жизнеспособность клеток Escherichia сoli М17 в биопленках. Журн. Микробиол. 2015. №6, с. 17-23.
8. О.Н. Вишневская, О.В. Рыбальченко, И.В. Ларионов *, О.Г. Орлова, А.Г. Марков. Сравнительный анализ плотных контактов эпителия тощей кишки крыс при действии липополисахарида и холерного токсина. Журн. Микробиол. 2016, №2, с.3-9.
9. Olga Stepanova, Oksana Rybalchenko, Alexander Astafiev, Olga Orlova, Anatoly Kudryavtsev, and Valentina Kapustina. A morphological study of the changes in the ultrastructure of a bacterial biofilm disrupted by an ac corona discharge in air. Journal of Applied Physics. 2016. V.120, р. 063302.
10. О.В.Рыбальченко, О.Г. Орлова, О.Н. Вишневская, В.В. Капустина, И.Л. Потокин, В.В. Лаврикова Особенности формирования бактериальных биопленок в условиях космического полета Журн. Микробиол. 2016, №6. с 3-10.
12 устных докладов за последние 3 года:
Наиболее значимые:
1. Bactericidal Action of DBD Plasma Jet in Helium at Varying Average Discharge Power. 6th International Conference on Plasma Medicine (ICPM-6), September 4-9, 2016, Bratislava, Slovakia.
2. Action of cholera toxin and lipopolysaccharide on tight junctions of rat small intestinal epithelium. DVG-Fachgruppe „Physiologie und Biochemie“ p.31-32. 30. März bis 01. April 2016 in Berlin, Germany.
3. Условно патогенная микробиота и эндогенные инфекции. XV Конгресс детских инфекционистов, 8-10 декабря 2016 г. Москва, Россия.